[JAVA] Verwendung von Bio-Formaten unter Ubuntu 20.04
Verwendung von Bio-Formaten.
- Laden Sie die Befehlszeilentools herunter
wget https://downloads.openmicroscopy.org/bio-formats/6.5.1/artifacts/bftools.zip
Entpacken Sie es zum Beispiel $ HOME / bin / bftools
Durch den Weg
.bash_profile
(Kürzung)
export PATH=$HOME/bin/bftools:$PATH
- Laden Sie ij.jar herunter
wget http://wsr.imagej.net/distros/linux/ij153-linux64-java8.zip
Entpacke und füge ij.jar in $ HOME / bin / bftools ein
- Laden Sie Beispieldaten herunter
wget https://downloads.openmicroscopy.org/images/OME-TIFF/2016-06/tubhiswt-2D.zip
Beim Entpacken gibt es die folgenden zwei Dateien
$ tree tubhiswt-2D
tubhiswt-2D
├── tubhiswt_C0.ome.tif
└── tubhiswt_C1.ome.tif
- Bildanzeige
showinf tubhiswt_C0.ome.tif
- Anzeigen von Bildern mit ImageJ
ijview tubhiswt_C0.ome.tif
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