Installation du client de ressources Web ChEMBL

introduction

Je suis sur le point d'étudier ChEMBL. Comme point de départ, j'ai trouvé une interface Python appelée client de ressources Web ChEMBL, donc je l'ai installée.

Qu'est-ce que le client de ressources Web ChEMBL?

La seule bibliothèque client officielle Python développée et prise en charge par le groupe ChEMBL. Utile pour accéder aux données ChEMBL et aux outils informatiques chimiques à partir de Python. Vous pouvez l'utiliser sans connaître SQL ou REST.

Installation

Sur l'environnement virtuel Anaconda de python3.6, j'ai pu utiliser conda comme suit.

conda install -c conda-forge chembl_webresource_client
Collecting package metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: done


==> WARNING: A newer version of conda exists. <==
  current version: 4.7.12
  latest version: 4.8.2

Please update conda by running

    $ conda update -n base -c defaults conda



## Package Plan ##

  environment location: /home/kimisyo/anaconda3/envs/chemlearn

  added / updated specs:
    - chembl_webresource_client


The following packages will be downloaded:

    package                    |            build
    ---------------------------|-----------------
    chembl_webresource_client-0.10.0|           py36_1          89 KB  conda-forge
    easydict-1.9               |             py_0           9 KB  conda-forge
    gevent-1.4.0               |   py36h516909a_0         2.5 MB  conda-forge
    greenlet-0.4.15            |   py36h516909a_0          22 KB  conda-forge
    grequests-0.4.0            |             py_0           6 KB  conda-forge
    requests_cache-0.4.13      |             py_0          16 KB  conda-forge
    ------------------------------------------------------------
                                           Total:         2.7 MB

The following NEW packages will be INSTALLED:

  chembl_webresourc~ conda-forge/linux-64::chembl_webresource_client-0.10.0-py36_1
  easydict           conda-forge/noarch::easydict-1.9-py_0
  gevent             conda-forge/linux-64::gevent-1.4.0-py36h516909a_0
  greenlet           conda-forge/linux-64::greenlet-0.4.15-py36h516909a_0
  grequests          conda-forge/noarch::grequests-0.4.0-py_0
  requests_cache     conda-forge/noarch::requests_cache-0.4.13-py_0


Proceed ([y]/n)? y


Downloading and Extracting Packages
easydict-1.9         | 9 KB      | ##################################################### | 100%
greenlet-0.4.15      | 22 KB     | ##################################################### | 100%
gevent-1.4.0         | 2.5 MB    | ##################################################### | 100%
chembl_webresource_c | 89 KB     | ##################################################### | 100%
grequests-0.4.0      | 6 KB      | ##################################################### | 100%
requests_cache-0.4.1 | 16 KB     | ##################################################### | 100%
Preparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: done

L'impression que j'ai essayé de l'utiliser est séparée.

référence

• https://github.com/chembl/chembl_webresource_client