Bar plot empilable avec matplotlib

Un mémo lors du traçage de la composition de la séquence d'acides aminés (dimension 20xN). La création d'un graphique empilé est assez simple. Vous pouvez spécifier bottom = hoge dans bar. Cependant, quand il y avait beaucoup de choses à venir, il était assez difficile d'ajuster l'emplacement de la légende. Ajustez la largeur du tracé avec get_position et set_position → Lorsque vous utilisez legend, ajustez la position avec bbox_to_anchor.

référence: http://geetduggal.wordpress.com/2011/08/22/grabbing-individual-colors-from-color-maps-in-matplotlib/ http://stackoverflow.com/questions/4700614/how-to-put-the-legend-out-of-the-plot http://matplotlib.org/users/legend_guide.html#plotting-guide-legend

plot_test.py


amino_count = ... # something;Ici 20x23 dimensions np.array
accent = get_cmap('accent')  #Obtenez une palette de couleurs
figsize(10, 8)     #Avec la taille de la figure
rcParams['font.size'] = 14     #Rendre les lettres un peu plus grandes
total = zeros(23)  #Enregistrer la somme pour l'empilement
ax = subplot(111)
for i in xrange(20):    #Pour chacun des 20 acides aminés
    c = accent(i / 20.0)    #colormap renvoie la valeur RGBA correspondante si vous entrez une valeur comprise entre 0 et 1.
    if i == 0:
        ax.bar(arange(23), amino_count[i], color=c, label=aa[i])
    else:
        ax.bar(arange(23), amino_count[i], color=c, bottom=total, label=aa[i])
        #Vous pouvez définir la limite inférieure de la barre en spécifiant le bas.
    total += tmd_count[i]

box = ax.get_position()
ax.set_position([box.x0, box.y0, box.width * 0.80, box.height])
#Définissez la largeur du tracé sur 80%.
h,l = ax.get_legend_handles_labels()
ax.legend(h[::-1], l[::-1], bbox_to_anchor=(1.25, 1.05))
# get_legend_handles_labels()Pour obtenir la poignée et l'étiquette de la légende.
#En utilisant cela, la légende est affichée dans l'ordre inverse.
#Aussi bbox_to_La position de la légende est ajustée à l'aide de l'ancre.
xlabel('Position from the N-terminal side of TMD', fontsize=16)
ylabel('Count', fontsize=16)

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