J'ai essayé de publier mon propre module pour pouvoir l'installer

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Module fait maison

pip install my_awesome_module

Pour le publier afin qu'il puisse être publié, vous pouvez le publier sur GitHub avec setup.py

GitHub page: https://github.com/kyohashi/model_selection

Qu'est-ce que pip install en premier lieu?

Je recherche un module dans PyPI (Python Package Index). Par exemple, si vous accédez à PyPI.org et recherchez numpy, ↓ https://pypi.org/

Certes, il est engourdi. ↓ https://pypi.org/search/?q=numpy

Lors de l'enregistrement d'un module dans PyPI, vous aurez besoin de setup.py, qui représente les méta-informations du module, ainsi que le code source du module. Pour résumer ce qui précède,

1. pip install hogehoge
2. Accédez à PyPI et recherchez name = hogehoge
3. Reconnaître et installer setup.py associé à hogehoge comme module de chargement

Vous pouvez comprendre que vous suivez la procédure.

Comment publier votre propre module

Il s'avère que vous pouvez pip installer en vous inscrivant auprès de PyPI, mais vous pouvez également le publier sur GitHub. Le fait est que vous n'avez qu'à me dire le code source et l'emplacement de setup.py, donc après vous être enregistré sur GitHub

pip install git+(URL)

Tout le monde peut l'installer. Cette fois, j'ai essayé de publier sur GitHub au lieu de PyPI.

Les fichiers enregistrés dans GitHub et setup.py sont les suivants.

organisation des fichiers

.
├── README.md
├── requirements.txt
├── setup.py
└── src
    └── model_selection
        ├── __init__.py
        ├── bayes_clustering.py
        └── utils
            ├── __init__.py
            └── check_datashape.py
    

setup.py

from glob import glob
from os.path import basename
from os.path import splitext

from setuptools import setup
from setuptools import find_packages


def _requires_from_file(filename):
    return open(filename).read().splitlines()


setup(
    name="model_selection",
    version="0.1.0",
    description="statistical model selection with Bayesian IC like WAIC",
    author="kyohashi",
    url="https://github.com/kyohashi/model_selection.git",
    packages=find_packages("src"),
    package_dir={"": "src"},
    py_modules=[splitext(basename(path))[0] for path in glob('src/*.py')],
    include_package_data=True,
    zip_safe=False,
    install_requires=_requires_from_file('requirements.txt')
)

Si vous regardez setup.py, vous pouvez voir qu'il reconnaît le fichier python sous le dossier src comme un module. Si vous enregistrez ce qui précède, tout ira bien

pip install git+https://github.com/kyohashi/model_selection.git

Est possible.

Contenu du module autodidacte publié

Le module créé cette fois a pour objectif d'aider à déterminer le nombre de clusters. Plus précisément, comme le montre la figure ci-dessous, le nombre optimal de clusters est estimé en modélisant et en calculant WAIC avec GMM pour tous les nombres de clusters candidats. PyMC3 est utilisé pour l'échantillonnage MCMC.

Il existe également un exemple de mise en œuvre pour Toy Data, veuillez donc vous y référer également. Usecase: https://kyohashi.github.io/model_selection/gmm_usecase.html