Créer un environnement d'apprentissage automatique sur Mac (pyenv, deeplearning, opencv)

Mémo pour la création d'un environnement Python sur Mac

1. Installez X-code

Depuis l'App Store.

2. Installez homebrew

Site officiel: http://brew.sh/index_ja.html

$ /usr/bin/ruby -e "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/master/install)"

Bonus wget

$ brew install wget

3. Installez Git

$ brew install git
$ git config --global user.name msrks
$ git config --global user.email <email>
# for check
$ git config —-global —-list

4. Définissez le thème Solarisé sur le terminal

$ mkdir config
$ cd config
$ git clone https://github.com/tomislav/osx-terminal.app-colors-solarized

Définissez solarized-dark comme valeur par défaut dans le menu des préférences du terminal

5. Installez atom

À partir de https://atom.io.

paramètres de l'éditeur

-Ne pas mettre en retrait lors du collage
- font-size: 16
-Enveloppement doux
-Largeur de l'onglet: 4

Présentation du package

- atom-runner : Ctrl+Le code peut être exécuté en R
- japanese-menu
- autocomplete-python
- python-indent
- file-icons
- minimap
- language-restructuredtext
- atom-beautify :Insérez autopep8 avec pip.

6. Installez Python

Mise à jour du système python2 (2.7.13). En même temps, «pip» est également entré.

$ brew install python
$ pip install numpy scipy matplotlib seaborn pandas

Mettez pyenv

$ brew install pyenv-virtualenv
$ cd
$ touch .bash_profile
$ open .bash_profile

export PYENV_ROOT=${HOME}/.pyenv
if [ -d "${PYENV_ROOT}" ]; then
    export PATH=${PYENV_ROOT}/bin:$PATH
    eval "$(pyenv init -)"
    eval "$(pyenv virtualenv-init -)"
fi

Inclut également python 3.6.0

$ pyenv install -l
$ pyenv install 3.6.0

7. Créez un environnement python2 pour la recherche

$ pyenv virtualenv system ML-2.7.13
$ pyenv global ML-2.7.13

data analysis

$ pip install jupyter
$ jupyter nbextension enable --py widgetsnbextension
$ pip install scikit-learn
$ pip install networkx
$ pip install statsmodels

web-development

$ pip install flask
$ pip install sphinx_rtd_theme mkdocs sphinx_rtd_theme

documentation

$ pip install sphinx mkdocs
$ pip install sphinx_rtd_theme sphinx_bootstrap_theme numpydoc

web-scraping

$ pip install beautifulsoup4 lxml

deeplearning (tensorflow, theano, chainer, keras, tflearn)

$ pip install tensorflow
$ pip install tflearn
$ pip install keras h5py
$ brew install graphviz
$ pip install pydot pydot-ng
$ pip install chainer

Traitement d'image

$ pip install scikit-image Pillow

# opencv
$ brew install gcc
$ brew install cmake
$ brew install tesseract
$ brew tap homebrew/science
# opencv2
$ brew install opencv
$ ln -s /usr/local/Cellar/opencv/2.4.13.2/lib/python2.7/site-packages/cv2.so /Users/riki/.pyenv/versions/ML-2.7.13/lib/python2.7/site-packages/

Docker for mac

https://docs.docker.com/docker-for-mac/ Icône de baleine dans la barre d'état> Préférences ...> Définissez «Paramètres du proxy HTTP:» dans l'onglet Avancé

OpenAI-gym

$ pip install gym
$ brew install swig
$ pip install gym[all]

OpenAI-Universe

$ brew install golang libjpeg-turbo
$ pip install numpy incremental
$ git clone https://github.com/openai/universe.git
$ cd universe
$ pip install -e .

Universe-Starter-Agent

$ brew install tmux htop
$ cd <workspace>
$ git clone https://github.com/openai/universe-starter-agent

wxpython [option]

$ brew install wxpython wxmac
#$ ln -s #/usr/local/Cellar/wxpython/3.0.2.0/lib/python2.7/site-packages/wx-3.0-osx_cocoa/wx #/Users/riki/.pyenv/versions/ML-2.7.13/lib/python2.7/site-packages/

opencv3 [option]

$ pyenv install anaconda3-4.1.1
$ cd <workspace with opencv3>
$ pyenv local anaconda3-4.1.1
$ conda install -c https://conda.anaconda.org/menpo opencv3
$ conda update hdf5

8. Contrôle de fonctionnement

opencv

$ mkdir workspace
$ cd workspace
$ wget --no-check-certificate -O gorilla.jpg https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/bc/Male_silverback_Gorilla.JPG/236px-Male_silverback_Gorilla.JPG
$ touch test-cv2.py
$ atom test-cv2.py

test-cv2.py


import cv2
img = cv2.imread("gorilla.jpg ")
img
cv2.imshow('image', img)
cv2.waitKey(0)
cv2.destroyAllWindows()
$ python test-cv2.py

keras: training

Cela n'a pas fonctionné au début. (Erreur dans le lien ci-dessous) http://qiita.com/Kodaira_/items/1a3b801c7a5a41c9ce49 Modifiez matplotlibrc en vous référant au lien

$ python -c "import matplotlib;print(matplotlib.matplotlib_fname())"
/Users/riki/.pyenv/versions/ML-2.7.13/lib/python2.7/site-packages/matplotlib/mpl-data/matplotlibrc
$ atom /Users/riki/.pyenv/versions/ML-2.7.13/lib/python2.7/site-packages/matplotlib/mpl-data/matplotlibrc

# line 38
- backend : macosx
+ backend : Tkagg
$ wget --no-check-certificate https://gist.githubusercontent.com/msrks/ea9ce906fe0c6a2947e7dec44291ec91/raw/ac8e24077e4127ae3dc392c3a4ca2235f3861aba/mnist_mlp.py
$ python mnist_mlp.py
$ open model_mlp.png
$ open log_acc.png
$ open log_loss.png

keras: prediction

$ wget --no-check-certificate -O gorilla.jpg https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/bc/Male_silverback_Gorilla.JPG/236px-Male_silverback_Gorilla.JPG
$ wget --no-check-certificate https://gist.githubusercontent.com/msrks/6422288f60f4f56a5d8fcbc95acf02dc/raw/e32966364ab08389490b5cadc260ba7220e42550/test_vgg16.py
$ python test_vgg16.py
$ open model_vgg16.png

9. Addendum

Afficher l'adresse IP dans la barre de menu

$ brew cask install ip-in-menu-bar

Rendre la commande d'arborescence disponible

$ brew install tree
$ tree -L <depth>

Il est pratique de désactiver la saisie semi-automatique et la conversion orthographique automatique lors de la saisie de caractères alphanumériques.

installation de mongoDB

https://docs.mongodb.com/manual/tutorial/install-mongodb-on-os-x/#install-mongodb-community-edition-with-homebrew

$ brew update
$ brew install mongodb

$ sudo mkdir /var/lib/mongodb
$ sudo touch /var/log/mongodb.log
$ sudo mongod --fork --dbpath /var/lib/mongodb --logpath /var/log/mongodb.log
$ brew services start mongodb
$ brew services list

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